1、有些净水器能自动冲洗。多数是一些中央型的，砾石、活性炭、树脂、不锈钢网。设定好时间或流量值，接好上下水，其它就不用人为干预了。2、有些净水器能手动动冲洗。主要是超滤膜、不锈钢网的。人工打开冲洗排水口进行。3、有些可以拆洗。主要是拆洗前置的超滤膜、PP棉、陶瓷等，冲洗完了装回去。4、大多数集成滤芯不能洗，到了指定过滤量必须更换新的。
过滤净水器使用一段时间以后可能有水垢产生，可以在里面放一些食醋或者是酸性的东西，倒点热水，这样就可以去除里面的水垢，还有就是净水器过滤的杂物可能沉淀到过滤层底部，可以拿出来清洗一下上面的污渍，这样就可以了。
1、开启外壳，取出过滤蕊条；2、将外罩内壁的污染物用水清洗干净；3、把过滤蕊条放置水中浸泡后再挤出留在里面的尘垢和污物，这样反复数次，直至没有残留物为止；4、用清水冲洗干净蕊条和外壳，安装回原型即可。
如果是分体式的一般是将净水器放在干净的盆中，将过滤的芯上下拧开，上层的圆盖打开后，有两层无纺棉布，用新的牙刷轻轻的放在水里刷干净，下层的（就是有很多层石头）下方有个塑料盖拧开，里面也有两层无纺棉布和沙石，各自轻轻的放在水里刷干净，再把过滤芯放入水后上下摇晃几下，最后将净水器的每一件都用水冲洗干净，并按原来的样子安装，即可。大约每隔一个月左右，就要清洗一次。
当龙头净水宝使用一段时期（一般1-2个星期）后，出水量会变小，当小到影响正常使用时，从净水器壳体中旋出滤芯，用砂纸或百洁布清洗即可（不需要用其他清洗剂）。刷洗时直至露出新的表层方可。
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